François est un jeune professeur de français dans un collège difficile. Dans sa volonté d'instruire sans pour autant domestiquer, François n'hésite pas à aller chercher les adolescents là où ça fait mal, les mettant souvent face à leurs limites afin de les motiver. Quitte à prendre parfois le risque du dérapage. "Entre les murs" filme la réalité d'une salle de cours durant toute une année, un documentaire pas vraiment, car chacun joue un rôle selon un scénario. Et le scénario suit le parcours d'un groupe d'élèves de quatrième. Oui réalité et fiction sont en fait habilement associées.